Das 32 edições da Copa do Brasil já disputadas, o Goiás Esporte Clube partipou de 28 competições. Nas temporadas 1993, 1994, 2005 não participou porque foi mal nos anos anteriores no Campeonato Goiano. Em 2006 ficou fora por um bom motivo, naquele ano quem participava da Copa Libertadores, ficava fora da disputa.
A melhor campanha foi em 1990 quando em sua trajetória eliminou Cruzeiro, Operário do Mato Grosso do Sul, Atlético Mineiro, Criciúma e na decisão acabou perdendo o título para o Flamengo que tinha Renato Gaúcho, Júnior, Uidemar, Zé Carlos e Gaucho.
O Goiás comandando por Sebastião Lapola tinha um timaço com Eduardo, Wilson Goiano, Richard, Boni, Jorge Batata, Lira, Fagundes, Dalton, Wallace, Josué, Luvanor, Péricles, Niltinho, Cacau, Túlio, Agnaldo, Rubens Carlos, Benevan, entre outros.
No primeiro ano da Copa do Brasil – 1989, o Goiás chegou até as semifinais e foi derrotado pelo Sport na Ilha do Retiro. Em 2003 outra grande campanha, e eliminação também nas semifinais para o Cruzeiro que acabou levantando o troféu.
Mas não foram só flores as participações do alviverde na competição. Alguns vexames com desclassificações logo na fase inicial para clubes pequenos como Democrata-MG, Botafogo-PB, River-PI, Rio Branco do Acre, Londrina e Remo.
Nesta quinta-feira (10), em Saquarema (RJ), o Goiás estreia na edição 2021. Vai enfrentar o Boavista – jogo com cobertura do Sistema Sagres de Comunicação. Confronto único, com o Verdão jogando pelo empate para avançar para 2ª Fase.
Participações do Goiás Esporte Clube
- 1989 – Chegou as semifinais e foi eliminado pelo Sport.
- 1990 – Melhor campanha na história, perdeu o título para o Flamengo
- 1991 – Chegou as quartas de final e caiu para o Criciúma.
- 1992 – Eliminado logo na 1ª Fase para o Remo.
- 1993 – Não participou. Estado de Goiás foi representado pelo Goiatuba.
- 1994 – Não participou. Vila Nova foi o representante goiano.
- 1995 – Eliminado na 1ª Fase pelo Democrata de Governador Valadares
- 1996 – Foi até a 2ª Fase e foi desclassificado pelo Criciúma.
- 1997 – Caiu na 1ª Fase para o Rio Branco do Acre.
- 1998 – Eliminado pelo Santos na 1ª Fase.
- 1999 – Boa campanha, chegou até as quartas de final e saiu para o Internacional.
- 2000 – Desclassificado na Serrinha nos pênaltis pelo ABC de Natal.
- 2001 – Eliminado pelo Coritiba nas oitavas de final.
- 2002 – Participou só da 1ª Fase, sendo eliminado pelo Londrina.
- 2003 – Excelente campanha, chegando até as semifinais com o Cruzeiro.
- 2004 – Foi até as oitavas de final com o Palmeiras.
- 2005 – Não participou. Estado de Goiás teve Crac e Vila Nova como representantes.
- 2006 – Não participou, já que estava na disputa da Copa Libertadores.
- 2007 – Foi até a 2ª Fase, sendo desclassificado pelo Bahia.
- 2008 – Caiu para o Corinthians nas oitavas de final após derrota em São Paulo.
- 2009 – Eliminado nas oitavas de final pelo Fluminense.
- 2010 – Eliminado pelo Vitória nas oitavas de final.
- 2011 – Mais uma eliminação nas oitavas, desta vez para o São Paulo.
- 2012 – Novamente o São Paulo no caminho do Goiás que saiu nas quartas de final.
- 2013 – Outra excelente campanha, foi até as semifinais com o Flamengo.
- 2014 – Desclassificado pelo Botafogo-PB logo na 1ª Fase.
- 2015 – Foi até a 3ª Fase e foi derrotado pelo Ituano.
- 2016 – Mais um desempenho ruim, eliminado pelo River-PI na 1ª Fase.
- 2017 – Avançou até a 4ª Fase e foi desclassificado pelo Fluminense.
- 2018 – Chegou as oitavas de final e caiu diante do Grêmio.
- 2019 – Eliminação na Serrinha e nos pênaltis para o CRB.
- 2020 – Foi até a 3ª Fase e nos pênaltis foi eliminado pelo Vasco da Gama.