O Dragão já participou de 5 edições da Copa do Brasil.

Em 2010 o fez sua melhor campanha. Parou na fase semifinal onde foi eliminado pelo Vitória da Bahia.

A primeira vez do Atlético aconteceu em 1989. O clube foi eliminado logo no início da competição para o Tiradentes do Distrito Federal.

O técnico do rubro negro era Paulo Neli, e a equipe tinha como base:

– Leonetti / Jatobá, Eugênio, Ferreira e Júnior / Marçal, Mauro Madureira, Jérson e Júlio César / Valdeir e Fernando Almeida.

A segunda participação aconteceu em 2007, já no ressurgimento do clube.

Estreia contra o Guarani e vitória pelo placar de 2×1.

– Márcio / Dida, Gílson, Jairo e Possato / Pituca, Dangelo, Robston e Anaílson / Fábio Oliveira e Wesley.

No ano seguinte a largada na Copa do Brasil foi contra o Ituiutaba(MG). Empate sem gols no interior de Minas.

– Márcio / Ari, Rafael, Gílson e Wellington / Pituca, Ricardo Araujo, Wesley e Lindomar / Juninho e Sorato.

Em 2010 o adversário na etapa inicial foi contra o Assu do Rio Grande do Norte. Vitória pelo placar de 3×0 e classificação sem a necessidade do jogo da volta.

– Márcio / Wesley, Gílson, Wescley e Júnior / Pituca, Robston, Erandir e Elias / Rodrigo Tiuí e Juninho.

Ano passado o Dragão perdeu para o Brusque – 3×2.

– Márcio / Adriano, Gílson, Anderson e Tiago Feltri / Agenor, Ramalho, Pituca e Anaílson / Felipe e Marcão.

O Atlético já realizou 27 jogos na história da Copa do Brasil:

12 vitórias

12 derrotas

3 empates

Marcou 34 gols e sofreu 34.

Já foi eliminado por Tiradentes, Atlético do Paraná, São Caetano, Vitória e Coritiba.

Já eliminou – Guarani, Fortaleza, Ituiutaba, Grêmio, Assu, Bahia, Santa Cruz, Palmeiras e Brusque.